2016年10月18日，我院绍兴分院与浙江古越龙山绍兴酒股份有限公司合作的浙江省重大科技专项项目“绍兴黄酒酿造微生物研究及产业化应用（计划编号：2013C02006-1）”，顺利完成验收。验收专家组成员认为，该项目采用的技术具有创新性，开辟了黄酒酿造微生物研究的新道路。
在本项目中，我院绍兴分院承担绍兴黄酒酿造微生物宏基因组研究，借助我院宏基因组学强大技术优势，对110个黄酒样本中所有微生物进行高通量测序，得到了样本中的微生物物种组成及其丰度，并运用生物信息学的方法进行样本间的差异分析，探讨了黄酒发酵过程中微生物组成与黄酒品质的关系，发现了对黄酒品质起关键作用的菌种，最终建立了绍兴黄酒特色的微生物菌群数据库。
该项研究的成果《Metagenomic sequencing reveals the relationship between microbiota composition and quality of Chinese Rice Wine》已经于2016年5月发表在Scientific Reports上，这也是中国科学家首次在Nature子刊上发表黄酒相关微生物组的研究成果。
