浙江加州国际纳米研究院

浙江大学“转录调控数据分析及R语言作图”研习班（第4期）招生通知

各高校及相关科研单位：

近年来，随着高通量测序技术的迅猛发展，转录组研究从以前的微阵列技术，SAGE及MPSS技术的低通量模式切换至RNA-seq的高通量模式。以RNA-Seq测序技术为基础的转录组测序作为高通量测序时代核心技术之一，已在生物科学及医学领域前沿研究中获得广泛应用。RNA-Seq可进行全基因组水平的基因表达差异研究，具有定量更准确、可重复性更高、检测范围更广、分析更可靠等特点，真核生物的基因表达调控，癌症等疾病的发生机制和新治疗方案确定，遗传育种等众多方面的研究具有不可估量的潜力。长链非编码RNA(LncRNAs)是一类长度超过200nt的非编码RNA分子，其表达水平相对于蛋白编码基因较低，但它们在Ｘ染色体沉默、基因组印迹、染色体修饰、转录激活、转录干扰以及核内运输等方面具有重要的功能，广泛参与细胞周期调控、生长发育、胚胎干细胞分化等多种生物学过程。近些年lncRNA的研究进展迅猛，许多动植物以及人类疾病的相关研究课题都离不开lncRNA的影子，其中基于NGS的的转录组分析技术在lncRNA的信息挖掘中起到了非常重要的作用。

为进一步帮助广大科研工作者快速掌握提升转录组高通量测序技术原理、实验设计以及后期数据分析技能，浙江大学历经15年的“基因组科学研习班”品牌项目原班人马联合浙江大学多位科研一线领军人才倾情推出“转录调控数据分析及R语言作图专题研习班”，通过理论授课与上机实践相结合的方式，每人一台PC机，紧随大屏幕演示“跟我学”操作。

培训内容：转录组测序技术前沿与课题设计、转录组测序数据分析基础、lncRNA测序数据分析及流程、Linux操作系统基础、R语言基础及绘图等。

培训时间：2018年07月12日到15日。（12日全天报到）

培训对象：具有一定生物信息学理论基础的科研工作者、教师或研究生。

培训地点：浙江大学圆正文景酒店（杭州市凯旋路431号）。

注册方式：

① 培训费：3300元/人（仅包含注册费、资料费、上机实践费）。

培训期间食宿自理，会务组可帮助预定。

②缴费方式（指定账号）
账户名称：浙江大学

账户号（开户行）：1202022309014406768（工行杭州市艮山支行）

汇款用途处写明：姓名+上机号（由会务组在回执确认函中提供）

③会务组联系方式：

代成林 0571-88206579（固） 18757558672（移） daichenglin@zju.edu.cn

余志扬 0571-88206579（固） 15257133716（移） yuzhiyang@zju.edu.cn

填写报名表并于报到前发送至genetrain@zju.edu.cn，上机实践由会务组提供机位，无需自带电脑。如有其它要求，请在备注中说明。

④非汇款学员可现场刷卡（含公务卡）或现金交纳

《转录调控数据分析及R语言作图》培训日程安排表

日期	时间	内容安排	报告人
07月12日	全天	杭州浙江大学圆正文景酒店（凯旋路431号）总台报到
13日（周五）	08:30~11:30	转录组测序技术前沿与课题设计 ü RNA-seq基本概况和技术发展简介 ü 高通量转录组技术流程及技术细节 ü 转录组学技术应用案例分析	刘鹏渊教授
13日（周五）	13:30~16:30	Linux操作基础 ü Linux系统下的常用命令 ü shell脚本的编写 ü linux环境下软件的安装使用	丛培宽副研究员
14日（周六）	08:30~11:30	R语言操作基础 ü R语言概述 ü R语言基础及统计学分析 ü R语言初级绘图	潘林林副研究员
14日（周六）	13:30~16:30	R语言绘图 ü 绘图函数和绘图参数的介绍 ü 表达量热力图的绘制 ü ggplot2绘图	王琳博士
15日（周日）	08:30~11:30	转录组数据分析实践（一） ü 转录组数据准备和软件介绍 ü 转录组数据的比对 ü 表达量估计和分析	徐建红教授刘振博士
15日（周日）	13:30~16:30	转录组数据分析实践（二） ü lncRNA的发展与应用 ü lncRNA测序数据分析 ü lncRNA测序分析流程与应用	郑冠涛博士

培训班主要师资简介

刘鹏渊 浙江大学转化医学研究院，浙江大学医学院附属邵逸夫医院教授、博士生导师。长期从事癌症遗传和基因组学、统计遗传学和生物信息学的研究。已在癌症遗传学、人类疾病遗传学、统计遗传学和生物信息学领域发表了76篇包括Nature Genetics，PloS Medicine，American Journal of Human Genetics和Cancer Research等SCI论文，第一、二作者SCI论文38篇，最高论文影响因子F=32.7（NatureGenetics），共被SCI刊物引用1300多次。2010年获教育部自然科学奖一等奖。

徐建红 浙江大学农业与生物技术学院教授、博士生导师，主要研究方向是作物基因组学与分子遗传育种，利用比较基因组学、生物信息学、进化生物学、分子生物学和转基因等方法和手段研究： 1.基因的表达与调控； 2.转座子转座机理； 3.作物基因组进化； 4.表观遗传学。研究内容已在PNAS、 Genome Research、PLoS Genetics、Molecular Biology and Evolution等高影响因子SCI杂志上发表。

丛培宽 杭州本因生物科技有限公司高级合伙人，浙江大学病理学与疾病生理学博士，浙江加州国际纳米技术研究院特聘副研究员，长期从事人类疾病全基因组和全外显子测序技术与数据分析工作，创建人类基因变异数据库LOVD的中国节点，在各种遗传病基因检测和诊断，遗传变异解读，遗传咨询等方面拥有丰富的经验。研究内容在Human mutation，Nature Genetics，Gene等SCI杂志发表。

潘林林 杭州本因生物科技有限公司高级合伙人，浙江加州国际纳米技术研究院特聘副研究员，长期从事转录组测序与分析，宏基因组测序数据分析及微生物多样性测序数据与分析工作。拥有丰富的转录组学实验设计及数据分析经验。研究内容在Nature Communications、Genomics等SCI杂志发表。

附件一：报名表

附件二：邀请函

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